1995年:ウィルカウンティ・クロウズ(Will County Claws)として創設。ノース・セントラル・リーグに加盟。 1996年:ハートランド・リーグに移籍し、チーム名をウィルカウンティ・チーターズ(Will County Cheetahs)に変更。 1998年:本拠地変更に伴い、チーム名をクックカウンティ・チーターズ(Cook County Cheetahs)に変更。同年、解散が決定していたハートランド・リーグ最後のリーグ優勝を飾る。 1999年:フロンティア・リーグに移籍。 2004年:チーム名を現在のウィンディシティ・サンダーボルツに変更。 2007年、2008年:2シーズン連続でリーグ優勝を達成。