欧州バイオインフォマティクス研究所

欧州バイオインフォマティクス研究所(EBI)



欧州バイオインフォマティクス研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)は、欧州分子生物学研究所(EMBL)を構成する主要な研究機関の一つです。イギリスの歴史ある大学都市ケンブリッジ近郊、ヒンクストンに拠点を構え、生命情報科学、すなわちバイオインフォマティクスの分野で先駆的な研究を進めています。

EBIの最も重要な役割の一つは、世界中の生命科学の研究を支える様々な重要なデータベースを構築・維持し、公開することです。これらのデータベースは、遺伝情報からタンパク質の構造、さらには低分子化合物の情報まで、生物学的な多様なデータを提供し、研究者にとって不可欠な情報源となっています。

EBIが提供する主要なデータベースには以下のようなものがあります。

EMBL:DNAやRNAなどの核酸配列に関する情報が集約されたデータベースです。これは、米国国立生物工学情報センター(NCBI)が運営するGenBank、そして日本の国立遺伝学研究所(NIG)DNAデータバンク(DDBJ)と協力し、世界で公開されるほぼ全ての塩基配列情報を共同で収集・公開しています。この三つのデータバンクは「DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データベース」を形成しており、塩基配列情報の国際的な流通と共有の中核を担っています。
UniProt:タンパク質の配列とその機能に関する詳細な情報を提供する、包括的なデータベースです。多くの研究プロジェクトで参照されており、タンパク質の特性を理解する上で極めて重要なリソースとなっています。
MSD(Macromolecular Structure Database):生体内で機能する高分子、特にタンパク質や核酸などの立体構造データを集めたデータベースです。構造情報は、分子の機能メカニズムを解明する上で不可欠です。
ChEMBL:医薬品として利用される化合物や、その候補となる生物活性を持つ低分子化合物の情報に特化したデータベースです。化合物がどのような標的に作用し、どのような生物活性を持つかなどのデータが収められています。

これらのデータベース群を通じて、EBIは遺伝学、分子生物学、医学、薬学など、幅広い生命科学分野における発見とイノベーションを強力に推進しています。国際的なデータ共有の取り組みにおいても中心的な役割を果たしており、生命情報のオープンアクセスと活用に貢献しています。

EMBLの部門として、EBIは単にデータを集積するだけでなく、そのデータを用いた高度な解析手法やツールを開発する研究活動も積極的に行っており、[バイオインフォマティクス]]研究の最前線を走り続けています。より詳細な情報は、EBIの公式ウェブサイト([https://www.ebi.ac.uk/)で確認できます。

関連する機関として、親組織である欧州分子生物学研究所(EMBL)のほか、国際塩基配列データベースを共に構築するGenBankやDDBJが挙げられます。ChEMBLは、提供するデータベースの名前としても、関連分野としても重要です。

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