DNAは生物の遺伝情報を担う重要な分子であり、通常は二本の鎖がらせん状に絡み合った二重らせん構造をしています。このDNAの鎖が何らかの原因によって物理的に断ち切られる現象を総称して「切断」(せつだん、英語: cut, scission)と呼びますが、その状態にはいくつかの種類があります。
二本鎖切断(切断)
主要なものの一つが「二本鎖切断」と呼ばれるものです。これは、DNAを構成する二本の鎖が、同じ位置またはごく近い位置で両方とも完全に切り離されてしまう状態を指します。例えるならば、一本のロープが真ん中でぷつりと二つに分かれてしまうようなものです。この二本鎖切断は、細胞にとって非常に危険な状態であり、放置されると遺伝情報の欠落や染色体の構造異常を引き起こし、細胞死やがんなどの原因となる可能性があります。そのため、細胞は強力な修復機構を備えています。
ニック (Nick)
これに対し、「ニック」(英語: nick)と呼ばれる状態は、二本鎖DNAのうち、一方の鎖だけが途中で切れている状態を指します。DNAの鎖は
ヌクレオチドという単位がリン酸と糖を介した
ホスホジエステル結合で連結してできていますが、この
ホスホジエステル結合が特定の場所で切断された結果、一方の鎖にギャップ(切れ目)が生じた状態がニックです。ニックは二本鎖切断ほど細胞にとって緊急性の高い状態ではありませんが、これも修復されずに放置されると、DNA複製や転写に影響を与えたり、最終的に二本鎖切断へと進行したりする可能性があります。
これらのDNAの切断やニックは、細胞が遺伝情報の安定性を維持するために重要な役割を果たしています。例えば、DNAが外部からの放射線や化学物質、あるいは細胞内で生じる代謝産物によって損傷を受けた場合、その損傷を修復する過程で意図的にDNAを切断することがあります。
特に、二本鎖切断は、高度な
DNA修復機構である「
相同組換え修復」を開始するための重要なシグナルとなります。
相同組換え修復では、損傷を受けたDNA領域とよく似た配列を持つ別のDNA分子(例えば相同染色体や姉妹染色分体)を鋳型として利用し、失われた遺伝情報を正確に再構築します。この修復の最初のステップとして、しばしば二本鎖切断が必要とされるのです。また、
相同組換えは、細胞分裂の際に遺伝的多様性を生み出すための染色体間の交差(乗り換え)の過程でも中心的な役割を果たしますが、この過程も二本鎖切断によって開始されることが知られています。
ニックもまた、
DNA修復の様々な経路(例えば塩基除去修復や
ヌクレオチド除去修復の一部の段階)において一時的に形成されたり、あるいは修復のターゲットとなったりします。また、DNA複製や遺伝子発現の調節に関わる酵素の中には、DNAに一時的なニックを導入することでその機能を果たすものもあります。
まとめ
このように、DNAの「切断」(特に二本鎖切断)や「ニック」といった現象は、単なる損傷としてだけでなく、細胞が自らの遺伝情報を維持し、正確に複製・分配し、さらには多様性を生み出すために不可欠な、制御された
生物学的プロセスとして理解されています。これらのメカニズムの解明は、遺伝病やがんの治療法開発においても重要な意義を持っています。