チミジル酸 (Thymidylic Acid)
チミジル酸は、デオキシリボ
核酸(DNA)を構成する基本的な単位である
ヌクレオチドの一種です。正式には
チミジン一
リン酸(thymidine monophosphate)と呼ばれ、dTMPと略記されます。この分子は、DNAの構成成分の一つである
チミン塩基に、デオキシ糖である2-
デオキシリボースと、1つの
リン酸基が結合した構造を持っています。
チミジル酸の構造では、
リン酸基が2-
デオキシリボースの特定の炭素原子にエステル結合しています。この結合位置によっていくつかの異性体が存在しますが、
生物学的に最も重要で、単に「チミジル酸」と呼ばれた場合に通常指されるのは、
リン酸基が2-
デオキシリボースの5'位の水酸基に結合した5'-チミジル酸(5'-dTMP)です。DNAのポリマー構造は、この5'-位の
リン酸基と、別の
ヌクレオチドの3'-位の水酸基との間で形成されるホスホジエステル結合によって構築されていきます。
DNA合成における役割
チミジル酸は、細胞が増殖する際に必須となるDNA合成の過程で中心的な役割を果たします。DNAを構成する4種類の
ヌクレオチド(dAMP, dGMP, dCMP, dTMP)のうち、
チミン(T)を含むdTMPは、他の3つとは異なる特殊な経路で合成されることが一般的です。
具体的には、まずデオキシ
ウリジン一
リン酸(dUMP)という
ウラシルを含む
ヌクレオチド前駆体が用意されます。このdUMPは、チミジル酸シンターゼという酵素の働きにより、
5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸をメチル基の供与体として利用し、メチル化されます。この反応によって、dUMPは
チミン塩基を持つチミジル酸(dTMP)へと変換されるのです。
dUMP +
5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸 + FADH₂ → dTMP +
ジヒドロ葉酸 + FAD
生成されたdTMPは、その後キナーゼ酵素によって段階的に
リン酸基が付加され、
チミジン二
リン酸(dTDP)、最終的には
チミジン三
リン酸(dTTP)へと変換されます。このdTTPが、DNAポリメラーゼによって既存のDNA鎖を鋳型として新規DNA鎖を合成する際に、DNAに取り込まれる直接の材料となります。取り込まれる際には、dTTPから2分子の
リン酸(ピロ
リン酸)が遊離し、残ったチミジル酸部分がDNA鎖の伸長方向である3'末端に結合していく形で取り込まれます。
DNA中のチミン塩基の特異性
DNAとよく似た
核酸であるリボ
核酸(RNA)は、
アデニン(A)、
グアニン(G)、
シトシン(C)、そして
ウラシル(U)という4種類の塩基を主に使用します。一方、DNAは通常、A、G、Cに加え、Uではなく
チミン(T)を使用します。
なぜDNAでは
ウラシルではなく
チミンが主に使われるのでしょうか。その理由は、DNAの安定性と遺伝情報の正確な維持に関係しています。
シトシン(C)は、細胞内で自然に
化学反応を起こし、脱アミノ化されて
ウラシル(U)に変化しやすいという性質を持っています。もしDNA中に元々
ウラシルが含まれていたら、この
シトシンから変化した
ウラシルと区別することが難しくなり、塩基配列の誤り(CがUに置換されたこと)を修復する機構がうまく機能しなくなってしまいます。
ここで
チミンが登場します。
チミンは、
ウラシル構造の5位の炭素にメチル基が付加された構造をしています。このメチル基があるおかげで、
チミンは
シトシンの脱アミノ化によって容易に生成されることはありません。したがって、DNA鎖中に
ウラシルが存在する場合、それはほとんどの場合、
シトシンが損傷して変化したものだと識別できます。これにより、DNA修復システムは
ウラシルを効率的に検出し、正しい
シトシンへと修復することが可能になります。
このように、DNAが
ウラシルではなく
チミンを採用していることは、
シトシンの自然な損傷による配列変化を防ぎ、遺伝情報の正確性を長期にわたって維持する上で極めて有利に働いていると考えられます。
(参考文献:一般的な生
化学、分子
生物学の教科書)