フラグメント分子軌道法(FMO法)
フラグメント
分子軌道法(FMO法)は、1999年に提案された先進的な
計算化学手法です。この方法は、
分子系を小さな部分、すなわちフラグメントに分割し、それぞれのフラグメント間の静電ポテンシャルの影響を考慮しつつ、
電子状態を計算することにより、全体のエネルギーおよび電子密度を算出します。特に、FMO法は超大規模な
分子系の解析に有用であり、複雑な
分子の性質を数値的に理解するための貴重なツールとなっています。
歴史と関連手法
FMO法は、北浦和夫とそのグループにより提唱され、その背景には1976年に開発されたエネルギー分解解析(EDA)があります。この方法は、
分子系をフラグメントに分けることで、クーロン場の影響を取り入れ、フラグメントの
電子状態計算をより正確に行えることが特色です。これにより、計算精度が向上し、キャップ原子を使用せずにフラグメントの
電子状態を明らかにできるようになりました。
FMO法と同等のアプローチとして、自己無撞着な計算を行うMCF法や、Incremental Correlation法(1992年に提案)などがあります。後者は多体展開を用いた方法で、FMO法と類似した特性を持ちながらも、相互作用の取り扱いにおいて異なる点があります。さらに、Gaoが提案したX-Pol理論は、液体の水に関する統計力学的シミュレーションで有望な応用が示されています。
FMO法の発表後も、多様な手法が提案されています。例えば、カーネルエネルギー法や、電荷移動を考慮した多体展開手法などがあります。これらの手法は、FMO法とその周辺技術の発展に寄与しています。
特徴
FMO法は、エネルギー、エネルギー勾配、電気双極子モーメントなど、システム全体の特性とともに、各フラグメント間の相互作用エネルギー(PIE)を明らかにします。このPIEは静電相互作用、
交換相互作用、電荷移動相互作用、分散相互作用に分けて解析することが可能で、この解析手法は相互作用解析(PIEDA)と呼ばれます。また、フラグメント間の配置解析や、MP2法を利用したフラグメント相互作用解析(FILM)も提案されています。
FMO法の計算では、さまざまな理論的手法が利用されます。これには、Hartree-Fock法、DFT、MCSCF法、TDDFT、CI、MP2、CCといった方法が含まれます。このため、FMO-HF法やFMO-MP2法など、計算手段によって手法名が異なることもあります。さらに、対象となる
分子を複数の領域に分けて、それぞれ異なる手法を適用する多層(ML-FMO)法も存在し、高精度の短時間でフラグメント間相互作用を評価することができます。
応用例
FMO法の応用分野として、主に生化学と溶液中の反応ダイナミクスが挙げられます。最近では無機化学における応用も増加しており、
スペクトル解析や化学反応の経路推定といった様々なシナリオで利用されています。特筆すべきは、2005年にFMO法を用いた光合成
タンパク質に関する計算が、スーパーコンピューティング分野のベストペーパー賞を受賞したことです。
FMO法は、
イオン液体や
窒化ホウ素リボン、シリカ系材料の計算においても成果を上げており、最近ではナノ構造体の取り扱いに対応した適応固定軌道法(AFO法)も導入されています。
対応コード
FMO法は、さまざまなプログラムで使用可能です。GAMESS(US)、ABINIT-MP、
PAICS、ADBS(Advance/BioStation)などがその例です。また、fuと呼ばれる新しいGUIが開発され、
PythonをベースにしたソフトウェアとしてFMO法やGAMESSをサポートしています。FacioもFMO法に特化したGUIで、
分子のフラグメント化とその相互作用分析を容易にする機能が備わっています。
FMO法は、
量子化学や
計算化学、
第一原理計算を実践する上で、非常に有用なツールとして位置づけられています。