4-ジホスホシチジル-2-C-メチルエリトリトール (CDP-ME)
4-ジホスホシチジル-2-C-メチルエリトリトール、略称CDP-MEは、多くの細菌や植物、そしてマラリア原虫などがイソプレノイドと呼ばれる多様かつ重要な天然物質を合成するために利用する「
非メバロン酸経路」(MEP経路、またはDOXP経路とも呼ばれます)において、中心的な役割を果たす中間代謝産物です。イソプレノイドは、ビタミン(例:ビタミンA、E、K)、ステロイドの骨格、色素(例:カロテノイド)、植物ホルモン(例:ジベレリン、アブシシン酸)、呼吸鎖における重要な成分(例:ユビキノン、プラストキノン)、そして多くの香料や医薬品など、生物にとって不可欠な機能を担う広範な化合物のグループです。
生物におけるイソプレノイド生合成経路は、主に二種類が知られています。一つは動物、菌類、一部の細菌などが用いる「メバロン酸経路」、もう一つがこのCDP-MEが登場する「
非メバロン酸経路」です。
非メバロン酸経路は、
ピルビン酸と
グリセルアルデヒド-3-リン酸という比較的単純な代謝物を出発点とし、一連の酵素反応を経て、イソプレノイドの普遍的な前駆体である
イソペンテニル二リン酸(IPP)とジメチルアリル二リン酸(DMAPP)を生成します。これらの二つの5炭素(C5)単位が、様々な長さや構造を持つイソプレノイドへと重合・修飾されていきます。
非メバロン酸経路は特に、植物の葉緑体や多くの細菌、およびアピコンプレックス門に属する寄生虫(マラリア原虫など)で主要なイソプレノイド供給経路として機能しています。
CDP-MEの生合成とその経路上の位置
非メバロン酸経路は通常7段階の酵素反応から構成されますが、CDP-MEはその経路の第3段階で生成される中間体です。具体的には、経路の初期段階で生成される
2-C-メチルエリトリトール-4-リン酸(MEP)を基質として合成されます。この反応を触媒するのは、4-ジホスホシチジル-2-C-メチル-D-エリトリトールシンターゼ(IspD)と呼ばれる酵素です。IspDは、MEPの構造に対し、シチジン三リン酸(CTP)から供給されるシチジル酸(CMP)部分を付加する反応を触媒します。この過程でピロリン酸(PPi)が遊離し、MEPのC3位のヒドロキシル基にシチジル酸がリン酸ジエステル結合として結合した形、すなわちCDP-MEが生成されるのです。
この反応を経て生成されたCDP-MEは、
非メバロン酸経路の次の段階へと進みます。次の段階では、CDP-MEキナーゼ(IspE)と呼ばれる酵素の働きにより、ATPからのリン酸基がCDP-MEのC2位のヒドロキシル基に付加され、4-ジホスホシチジル-2-C-メチルエリトリトール-2-リン酸(CDP-MEP)へと変換されます。このように、CDP-MEはMEPからCDP-MEPへの重要な橋渡し役として機能しており、経路の進行に不可欠な存在です。
非メバロン酸経路の重要性と薬剤ターゲットとしての可能性
非メバロン酸経路は、植物がテルペン類などの二次代謝産物を合成する上で極めて重要であるだけでなく、多くの病原性細菌(例:結核菌、大腸菌、肺炎球菌など)やマラリア原虫が生育に不可欠なイソプレノイドを生合成する唯一の経路として利用しています。一方、ヒトを含む動物はこの経路を持たず、代わりにメバロン酸経路を用いてコレステロールなどのイソプレノイドを合成しています。この「ヒトには存在せず、病原体には存在する」という特徴から、
非メバロン酸経路は、新しいクラスの抗菌薬や抗マラリア薬を開発するための有望なターゲットとして世界中で研究が進められています。CDP-MEを生成する酵素IspDや、CDP-MEを基質とするIspEを含む経路上の酵素は、薬剤設計の標的候補となっています。これらの酵素の働きを特異的に阻害することで、病原体の生存に必要なイソプレノイドの合成を停止させ、感染症の治療につなげることが期待されています。
したがって、4-ジホスホシチジル-2-C-メチルエリトリトール(CDP-ME)は、単なる中間体ではなく、イソプレノイドという生命維持に不可欠な物質群を作り出す
非メバロン酸経路において、その進行を保証する重要な位置を占める分子であり、創薬研究の観点からも大きな注目を集めています。
関連項目
非メバロン酸経路
4-ジホスホシチジル-2-C-メチル-D-エリトリトールシンターゼ (IspD)
イソプレノイド
メバロン酸経路