組換えDNA(recombinant DNA、略称:rDNA)とは、自然界に存在するDNAとは異なり、複数の生物種に由来する遺伝子情報を実験室の手法を用いて人工的に連結させたDNA分子を指します。
仕組みと作製
すべての生物のDNAは基本的に共通した化学構造を持っていますが、その違いは
ヌクレオチド(塩基)の並び順にあります。この普遍的な構造があるため、異なる生物のDNA断片を結合させることが可能です。異なる種のDNAを組み合わせることから、
ギリシア神話の合成獣
キマイラにちなんで「キメラDNA」とも呼ばれることがあります。
組換えDNAを作るための主要な技術の一つが「分子クローニング」です。これは、特定のDNA配列を増幅させるために広く用いられる実験手法であり、DNAの「切り貼り」を伴います。
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)もDNAを増幅させる手法ですが、分子クローニングが生きた細胞内でDNAを複製するのに対し、PCRは試験管内で行われ、既存の配列をコピーする点で異なります。
組換えDNAを細胞内で増やすためには、「クローニングベクター」と呼ばれる、自己複製能力を持つ比較的小さなDNA分子が必要です。ベクターには、外来DNAを挿入する部位や、組換えDNAを持つ細胞を選び出すためのマーカー遺伝子などが組み込まれていることが多く、主に
細菌の
プラスミドや
ウイルスDNAが利用されます。DNA断片の結合には、DNAを切断する「
制限酵素」と、断片同士を繋ぎ合わせる「
DNAリガーゼ」が用いられるのが一般的です。その他にも、ギブソン・アセンブリなど様々な手法が存在します。
一般的な組換えDNA作製プロセスは、以下のステップで進められます:
1. 目的のDNA配列を含むDNAと、導入先の宿主細胞に適したクローニングベクターを選ぶ。
2. ベクターDNAを、外来DNAを挿入できるよう準備する。
3. クローニングしたい目的のDNA断片を準備する。
4.
制限酵素やリガーゼなどを用いて、ベクターと目的DNA断片を連結させ、組換えDNA分子を作る。
5. 作製した組換えDNAを、
細菌や酵母などの宿主細胞に導入する。
6. 組換えDNAがうまく導入された細胞を選び出す。
7. 目的のDNA配列が正しく挿入され、意図した性質を持つ細胞群(クローン)を選別・増殖させる。
宿主細胞での挙動と影響
宿主細胞に導入された組換えDNAは、単に細胞内で複製されるだけでなく、そこに含まれる遺伝情報に基づいて「組換え
タンパク質」を生産するために利用されることもあります。ただし、
タンパク質を生産するには、
プロモーターやターミネーターといった、宿主細胞の転写・翻訳システムが認識できる特定の調節配列が遺伝子の前後に必要となります。効率よく
タンパク質を作らせるために、宿主細胞側を改良したり、作られる
タンパク質の形を調整したりする場合もあります。
多くの組換えDNAを含む生物は、外見や振る舞いに目立った変化を示さないことが一般的です。組換えDNAの存在を確認するには、DNAそのものを分析するPCRなどの手法が主に用いられます。しかし、組換え遺伝子が発現している場合は、作られたRNAや
タンパク質(組換え
タンパク質)を検出するRT-PCRや
ウェスタンブロッティングといった方法で確認できます。
組換えDNAが宿主細胞に予期せぬ影響を与える可能性もゼロではありません。例えば、組換えDNAが宿主細胞自身の重要な遺伝子の中に挿入されてしまい、その遺伝子の働きを失わせる「挿入不活性化」を引き起こすことがあります。また、挿入された組換えDNAが、通常は働いていない宿主細胞の遺伝子を活性化させてしまう可能性も指摘されています。このような現象は、基礎
研究で遺伝子の機能を調べるために意図的に利用されることもあります。
多様な応用分野
組換えDNA技術は、基礎
研究から産業、
医療、農業に至るまで、現代の生命科学やバイオテクノロジーにおいて不可欠な技術となっています。
研究室での遺伝子機能解析や遺伝子マッピング、
タンパク質の生産に利用されるのはもちろん、私たちの生活にも広く浸透しています。
具体的な応用例としては、以下のようなものが挙げられます。
医療分野: 糖尿病治療薬の
ヒトインスリン、低身長症などに用いられる
ヒト成長ホルモン、
血友病患者のための血液凝固因子など、重要な医薬品の多くが組換え
タンパク質として生産されています。これらはかつて動物や献血由来でしたが、組換え技術により安全かつ安定した供給が可能になりました。また、
B型肝炎ワクチンのように、組換え技術を用いて病原体の一部(抗原)を作り出し、免疫を誘導するワクチン開発にも貢献しています。HIV検査においても、組換え技術で製造されたHIV
タンパク質が
抗体検出に利用されています。
食品産業: チーズ製造に必要なキモシン
酵素は、かつて子牛の胃から得られていましたが、現在では組換え技術によって微生物に生産させており、低コストで大量供給されています。
農業: 特定の除草剤に耐性を持つダイズやトウモロコシ、あるいは害虫が食べると死ぬ
タンパク質(Bt毒素)を作るイネやワタなど、農作物の品種改良に利用されています。また、ビタミンA前駆体を生成するよう改良された「ゴールデンライス」のような開発も進められています。
基礎研究: 特定の遺伝子の機能を調べたり、遺伝子の発現パターンを解析したりするための実験材料として、組換えDNAは日常的に使われています。
歴史と論争
組換えDNAの概念は1960年代後半に生まれ、1970年代初頭に
スタンフォード大学と
カリフォルニア大学サンフランシスコ校(UCSF)の
研究者らによって初めて作製、細胞内での複製に成功しました。この分野のパイオニアたち、特にポール・バーグ博士らはノーベル賞を受賞しています。
制限酵素の発見も組換えDNA技術の発展に大きく貢献し、その発見者たちもノーベル賞を受けています。組換えDNA技術に関する最初の米国特許は1980年に取得され、この技術を用いた初の医薬品である
ヒトインスリンが
ジェネンテック社とイーライリリー社によって開発されました。
組換えDNA技術の登場当初、
研究者自身が潜在的なリスク、特に組換えDNAを持つ生物が環境に与える影響について懸念を表明しました。1975年に開催されたアシロマ会議では、一時的な
研究の自主停止や、より安全な実験のためのガイドライン策定が話し合われました。現在では、組換えDNA分子そのものが危険視されることは少なくなりましたが、組換えDNAを含む生物が環境中へ意図せず拡散した場合のリスクや、組換え
タンパク質医薬品の製造過程で生じる微量の不純物(宿主細胞由来
タンパク質など)が人体に与える影響などについて、継続的な議論と安全管理が行われています。