遺伝子サイレンシングとは
遺伝子サイレンシング(gene silencing)は、細胞が持つ重要な
遺伝子発現制御機構の一つであり、特定の
遺伝子の働きを抑制または停止させる現象を指します。この過程は、DNA配列そのものを変化させることなく、主に
クロマチンの構造変化や修飾を通じて行われるため、
エピジェネティクス的な
遺伝子制御に分類されます。
遺伝子サイレンシングという言葉は、
遺伝子組み換え技術によらず、細胞が内的に
遺伝子の「スイッチを切る」際に広く用いられます。本来発現しているはずの
遺伝子が、細胞内のさまざまな機構によって意図的に不活性化されることを意味します。
主なメカニズム
遺伝子サイレンシングは、作用する段階によって大きく二つに分類されます。
転写型遺伝子サイレンシング (Transcriptional Gene Silencing, TGS)
転写型サイレンシングは、
遺伝子からメッセンジャーRNA(mRNA)が合成される「
転写」の段階そのものを停止させるメカニズムです。これにより、遺伝情報がmRNAとして読み出されなくなるため、結果としてその
遺伝子から作られる
タンパク質などの産物ができなくなります。
TGSは、主にDNAのメチル化や
ヒストンタンパク質の化学修飾など、
クロマチン構造の改変によって引き起こされると考えられています。これらの修飾は、
遺伝子領域への
転写因子やRNAポリメラーゼといった
転写 machinery のアクセスを物理的に妨げたり、
転写抑制因子をリクルートしたりすることで、
転写開始を抑制します。
代表的な現象として、
ゲノムインプリンティング、パラミューテーション、
トランスポゾン抑制、トランスジーン抑制、配置効果などが挙げられます。
転写後遺伝子サイレンシング (Post-Transcriptional Gene Silencing, PTGS)
転写後サイレンシングでは、
遺伝子の
転写自体は行われ、mRNAが合成されますが、そのmRNAが翻訳される前に特異的に分解されたり、翻訳が阻害されたりします。これにより、
遺伝子の産物(
タンパク質など)が効果的に作られなくなります。
PTGSの最もよく知られたメカニズムはRNA干渉(RNAi)です。細胞内に存在する短い二本鎖RNA(siRNAやmiRNA)が特定のmRNAを標的として結合し、mRNA分解を誘導する複合体(RISC)へと導きます。その他にも、ナンセンスコドンを持つmRNAを分解するナンセンス仲介減衰(NMD)などもPTGSの一種です。
実験的に
遺伝子サイレンシングを誘導する手法としては、
リボザイム法やアンチセンス法といった、標的mRNAの分解や翻訳阻害を目指すアプローチも用いられます。
機能と役割
遺伝子サイレンシングは、細胞内で多様な重要な役割を担っています。
1.
内生遺伝子の発現調節: 細胞の発生、分化、機能維持に必要な特定の
遺伝子の発現レベルを精密に調整するために利用されます。
ゲノムインプリンティングのように、親由来によって
遺伝子の発現が制御される現象も含まれます。
2.
ゲノムの安定性維持: トランスポゾン(動く
遺伝子)や
ウイルスのような外来性の核酸が
ゲノム内で活性化されるのを抑制し、
ゲノム構造の安定性を維持する防御機構として機能します。多くの生物では、これらの外来因子に由来するRNAがサイレンシングのきっかけとなることがあります。
3.
細胞の防御機構: 古代から細胞が持つ、病原体(特に
ウイルス)などの感染から
ゲノムを守るための免疫機構の一つであると考えられています。外来核酸を認識し、その働きを抑制することで、細胞を保護します。
特定の発生段階、例えば
アカパンカビの減数分裂期では、DNAのメチル化によって
遺伝子がサイレンシングされることが観察されており、生命現象の様々な局面でこの機構が利用されていることが示されています。
関連する主要な細胞成分
遺伝子サイレンシングには、様々な分子や細胞構造が関与します。
クロマチン: DNAと
ヒストンタンパク質が複合体を形成したもので、その構造や修飾状態(
ヒストン修飾など)がTGSにおいて
遺伝子へのアクセスを制御します。ヘテロ
クロマチンは特に
転写が抑制された領域に関連が深いです。
miRNA (micro-RNA) および siRNA (small interfering RNA): PTGS、特にRNAiの中心となる短い二本鎖RNA分子です。標的mRNAの認識と分解に関与します。
二重鎖RNA (dsRNA): siRNAやmiRNAの前駆体となったり、それ自体がサイレンシングのトリガーとなったりします。
ダイサー (Dicer): 長い二重鎖RNAやmiRNAの前駆体を、siRNAや成熟miRNAといった機能的な短い断片に切断する酵素です。
*
トランスポゾン: ゲノム内を移動できる配列であり、その活性がしばしば
遺伝子サイレンシングによって抑制されます。
遺伝子サイレンシングの研究は、生命現象の理解だけでなく、
遺伝子機能の解析(
遺伝子ノックダウンなど)や疾患治療への応用という観点からも注目されています。