CPR群

CPR（Candidate Phyla Radiation）についての詳細

CPR、すなわちCandidate Phyla RadiationまたはPatescibacteriaは、細菌の中でも特異な巨系統群を形成しています。このグループは、現在までに培養された例がなく、記載種も存在していないため、非常に興味深い研究対象となっています。最も注目すべきは、全細菌の中で少なくとも15パーセント以上を占める可能性があるという点です。ただし、その進化的歴史や多様性については、研究者の間で依然として様々な議論が交わされています。

初期の系統樹の分析によれば、CPRは極めて古い分岐に位置すると考えられており、他の全細菌に対して姉妹群としての関係を築いているとされます。この群に属する細菌は、細胞のサイズが非常に小さく、特殊な遺伝子構成を持っていることが特徴です。最新のゲノム解析では、TCA回路や電子伝達系を持たない種が多く、さらに核酸やアミノ酸を自ら合成する能力を欠いていることが示されています。

CPR細菌は、一般の細菌とは異なり、リボソームRNA（rRNA）中にイントロンを含むことがあります。この特異な特徴により、従来のPCRベースの微生物検出手法では容易に発見されることがありませんでした。また、ゲノムのサイズや細胞サイズが小さいといった性質に加え、長い間認知されていなかったにもかかわらず、多様性が高く古細菌のDPANN群と共通する点がいくつか存在します。

しかし、最近の研究はCPRを異なる視点から見直すきっかけになりました。特に、CPR細菌はテッラバクテリア内のグラム陽性菌系統に位置し、特にクロロフレクサス門との近縁性が示唆されています。この結果は、CPR細菌が自由生活性の細菌から進化したことを示すものであり、CPRの起源は従来考えられていたよりも新しい可能性が高いと考えられます。興味深いことに、CPR細菌はグラム染色で陰性とされますが、多くのCPR細菌が外膜を持たず、構造的にはグラム陽性菌に似ている点も注目されます。

Genome Taxonomy Database（GTDB）は、CPRに対して1つの門・Patescibacteriaのみを割り当てており、この群に対する分類学的な理解も進んでいくことでしょう。今後の研究により、CPRが持つ多様性や生態系に与える影響が明らかになることが期待されます。

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