タンパク質のアイソフォーム(バリアント)とは、一つの
遺伝子または
遺伝子ファミリーから生成される、構造や組成が類似した一連の
タンパク質のことです。多くの場合、これらのアイソフォームは同一または類似の生物学的機能を果たしますが、一部には特定のアイソフォームのみが持つ固有の機能も存在します。
アイソフォームの生成機構
アイソフォームは、主に以下の機構によって生成されます。
選択的スプライシング: mRNA前駆体から、スプライシングの過程で異なる
エクソンを選択することで、複数のmRNA配列が生成されます。
プロモーター利用の差異: 転写開始時に異なる
プロモーターを利用することで、異なる転写産物が生成されます。
遺伝的変化: 変異や
多型などの遺伝的変化も、異なるアイソフォームとして認識されることがあります。
これらの機構により、一つの
遺伝子から複数の異なる
タンパク質がコードされることで、
プロテオームの多様性が増大します。
アイソフォームの多様性と機能
各アイソフォームは、
タンパク質の構造と機能、細胞の種類、発生段階などによって、その特異性が決定されます。
タンパク質が複数のサブユニットから構成され、各サブユニットに複数のアイソフォームが存在する場合、特異性の決定はさらに複雑になります。
例えば、AMP活性化プロテインキナーゼ(AMPK)は、3つのサブユニット(α、β、γ)から構成され、各サブユニットに複数のアイソフォームが存在します。これらのアイソフォームの組み合わせによって、AMPKは細胞内で多様な機能を果たします。
アイソフォーム研究の現状と課題
ヒトゲノム計画によって
タンパク質コード
遺伝子の数が明らかになった一方で、個体に見られる
タンパク質の多様性との間には大きな隔たりが存在します。アイソフォーム形成機構の発見は、この隔たりを説明する上で重要な役割を果たしています。
しかし、mRNA転写産物レベルでのアイソフォームの存在量と、
タンパク質レベルでのアイソフォームの存在量とは必ずしも相関していません。また、
選択的スプライシングによる多様性と疾患との関連性も示唆されていますが、
選択的スプライシングが新規アイソフォームを生み出す主要な機構であるという決定的な証拠は得られていません。
今後の研究では、アイソフォームの機能解析や、RNAレベルと
タンパク質レベルの相違が生じる機構の解明が重要となります。
アイソフォームと関連する概念
グリコフォーム
グリコフォームとは、付加された
糖鎖の数や種類のみが異なる
タンパク質のことです。
糖タンパク質はしばしば、異なるグリコフォームから構成されます。
アイソフォームの例
アクチン: 哺乳類では少なくとも6種類のアイソフォームが存在します。
クレアチンキナーゼ: 心筋梗塞の診断に利用される3つのアイソフォームが存在します。
ヒアルロン酸合成酵素: 哺乳類細胞では3つのアイソフォームが存在します。
グルクロン酸転移酵素: ヒトゲノムには16種類のアイソフォームがコードされています。
モノアミン酸化酵素: MAO-AとMAO-Bの2つのアイソフォームが存在します。
まとめ
タンパク質のアイソフォームは、
遺伝子の多様性を反映する重要な存在です。アイソフォームの研究は、生命現象の理解を深め、疾患の診断や治療に役立つ可能性があります。今後の研究の進展が期待されます。