オリゴ
ペプチドは、2個から20個のアミノ酸が
ペプチド結合によって連なった鎖状の分子です。
ジペプチド、トリ
ペプチド、テトラ
ペプチド、ペンタ
ペプチドなどがこのカテゴリーに含まれます。現在、600種類以上のオリゴ
ペプチドが知られており、そのうちの約半分は、分子構造に基づいて以下の7つのグループに分類されています。
アエルギノシン
シアノペプトリン
ミクロシスチン
ミクロビリジン
ミクロギニン
アナベノペプチン
シクラミド
この中で、特にミクロシスチンは、飲料水への潜在的な毒性の影響があるため、最も研究が進められています。オリゴ
ペプチドの分類としては、シアノペプトリンが最も多く(40.1%)、次いでミクロシスチン(13.4%)となっています。
オリゴ
ペプチドの多くは、非
リボソームペプチド合成酵素によって生成されます。しかし、シクラミドとミクロビリジンは、
リボソーム経路によって生成される点が異なります。
以下に、いくつかのオリゴ
ペプチドの例を挙げます。
アマニチン: 数種類の
キノコから抽出される環状
ペプチドで、
RNAポリメラーゼの強力な阻害剤として作用します。真核生物のmRNAおよび
タンパク質合成を阻害し、特にα-アマニチンは
タマゴテングタケの主要な毒素です。
アンチパイン: いくつかの
細菌によって生成され、
プロテアーゼ阻害剤として働きます。
セルレチド: イエアメガエルの皮膚から発見されたデカ
ペプチドで、
コレシストキニンと類似の活性を持ち、
胃、胆道、
膵臓の分泌を促進します。
グルタチオン: 細胞内で重要な役割を果たすトリ
ペプチドで、薬物の可溶化、酵素の
補因子、
タンパク質の
ジスルフィド結合の再構成、
過酸化物の還元などに関与します。
ロイペプチン: 放線菌によって産生される
アシル化オリゴ
ペプチドで、
トリプシン、
プラスミン、カリクレインなどの
プロテアーゼを阻害します。
ネトロプシン: Streptomyces netropsisから単離されたポリ
ペプチドで、細胞毒性があり、DNAのA-T領域に特異的に結合します。
ペプスタチン: 放線菌の培養液から単離されたオリゴ
ペプチドで、ペプシンや
レニンなどの酸性
プロテアーゼを阻害します。
ペプチドT: HIVエンベロープ
タンパク質gp120と配列相同性を持つオクタ
ペプチドで、
エイズ治療における抗ウイルス剤としての可能性が研究されています。
ファロイジン: タマゴテングタケから単離された毒性の高いポリ
ペプチドで、
肝臓、
腎臓、
中枢神経系に損傷を与えます。
テプロチド: ハララカの毒に由来するノナ
ペプチドで、
キナーゼIIとアンジオテンシンIを阻害し、降圧剤としての利用が期待されています。
タフトシン: 脾臓で生成されるテトラ
ペプチドで、顆粒球や
好中球の貪食活性を刺激します。
関連用語
オリゴエステル: エステル結合によって結合した少数のモノマーからなる化合物。
オリゴマー: 少数の繰り返し単位からなる重合体。
オリゴペプチダーゼ: オリゴ
ペプチドを分解する酵素。
ペプチド合成: ペプチド結合を形成してアミノ酸を連結させる化学反応。
プロテアーゼ: タンパク質を分解する酵素。
参考資料
Structural Biochemistry/Proteins/Amino Acids (Wikibooks)