一本鎖マイナス鎖RNAウイルス
一本鎖マイナス鎖RNA
ウイルスは、その名の通り、一本の鎖からなる(−)鎖のRNA((−)ssRNA)を遺伝情報として保持する
ウイルスの大きなグループです。この
ゲノムは、
ウイルスの増殖に必要なメッセンジャーRNA(mRNA)を合成する際に、鋳型として直接機能することができません。そのため、これらの
ウイルスは
RNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)という、自らの遺伝子にコードされた酵素を持っています。RdRpは、(−)鎖
ゲノムを読み取り、その相補鎖である(+)鎖のmRNAを作り出します。
ウイルスの
ゲノム複製もRdRpによって行われます。RdRpはまず(−)鎖
ゲノムを鋳型にして、その相補鎖である(+)鎖の「アンチ
ゲノム」を合成します。次に、このアンチ
ゲノムを鋳型として、新たな(−)鎖
ゲノムのコピーを多数合成します。
(−)ssRNA
ウイルスには多くの共通点が見られます。多くの
ウイルス粒子(
ビリオン)は、遺伝情報を包む
カプシドの外側を
脂質膜であるエンベロープで覆われています。
ゲノムは通常、環状ではなく直鎖状です。また、
ゲノムが複数のRNA分子に分かれている「分節化」が見られることが一般的です。
分類と進化
(−)ssRNA
ウイルスは、
ウイルスの広範な分類体系において、リボ
ウイルス域(Riboviria)のオルソルナ
ウイルス界(Orthornavirae)に属する
ネガルナウイルス門(Negarnaviricota)を形成しています。遺伝子解析に基づくと、これらの
ウイルスは二本鎖RNA
ウイルスと共通の祖先を持ち、特にレオ
ウイルスの
姉妹群であると考えられています。ネガルナ
ウイルス門は、主に2つの亜門に分けられます。一つはハプロ
ウイルス亜門(Haploviricotina)で、
ゲノムが分節化されていないものが多く、RdRpが
ウイルスmRNAのキャップ構造を自ら合成します。もう一つはポリプロ
ウイルス亜門(Polyploviricotina)で、
ゲノムが分節化されており、RdRpは宿主細胞のmRNAからキャップ構造を奪って(キャップスナッチング)利用する特徴を持ちます。この門には合計6つの綱が確認されています。
進化の過程で、(−)ssRNA
ウイルスは
節足動物と密接な関係を築いてきました。
節足動物を媒介者として他の生物に感染するものと、
節足動物の助けなしに脊椎動物間で伝播するように適応したものが存在します。著名な
節足動物媒介性の
ウイルスにはリフトバレー熱
ウイルスやトマト黄化えそ
ウイルスがあり、脊椎動物に重篤な疾患を引き起こすものとしては、エボラ
ウイルス、ハンタ
ウイルス、
インフルエンザウイルス、ラッサ
ウイルス、
狂犬病ウイルスなどが挙げられます。
(−)ssRNA
ウイルスの
ゲノムは一本鎖の(−)鎖RNAです。
ウイルス粒子に取り込まれたRdRpは、この(−)鎖
ゲノムを鋳型としてmRNAを合成します。テヌイ
ウイルス属やミ
ウイルス属の一部を除き、
ゲノムは直鎖状です。
ゲノムが分節しているかどうかはグループによって異なり、1つの断片からなるものから10個以上の断片を持つものまであります。
ゲノムの両端には回文配列(逆向き反復配列)が存在し、複製や転写の際に重要となります。
ゲノム複製は、RdRpが
ゲノムの3'末端にある特定の配列(リーダー配列)に結合することから始まります。RdRpは(−)鎖
ゲノムを最後まで読み取り、(+)鎖のアンチ
ゲノムを完全に合成します。次に、このアンチ
ゲノムを鋳型として、(−)鎖
ゲノムを合成します。この際、RdRpはアンチ
ゲノム上の遺伝子転写に必要なシグナルを無視し、アンチ
ゲノム全体を読み進めます。
ゲノム複製は、
ゲノムが
カプシドタンパク質と結合したリボヌクレオ
カプシドの状態で行われます。RdRpが
ゲノムを複製するにつれて、
カプシドタンパク質が新しく合成されたRNAを取り囲んでいきます。
mRNAの合成(転写)もRdRpによって行われます。RdRpは
ゲノムのリーダー配列から転写を開始し、mRNAの5'末端にキャップ構造を付加します。このキャップ構造の付加方法は亜門によって異なり、ハプロ
ウイルス亜門ではRdRpがキャップを合成し、ポリプロ
ウイルス亜門では宿主のmRNAからキャップ構造を奪います。キャップ付加後、RdRpは各遺伝子の
開始コドンから終止コドンまでを転写し、終止コドンに到達すると転写を終了します。多くのmRNAの3'末端には、数百個の
アデニンが連なったポリアデニル化テール(ポリ(A)テール)が付加されます。
一部の(−)ssRNA
ウイルスは「アンビセンス」と呼ばれる
ゲノム構造を持ちます。これは、
ゲノムの(−)鎖自体が遺伝子をコードしている領域と、アンチ
ゲノムの(+)鎖が遺伝子をコードしている領域が混在していることを意味します。このような
ウイルスでは、
ゲノムからの直接的な転写と、アンチ
ゲノムからの転写の両方が行われます。
形態
(−)ssRNA
ウイルス粒子は、
ゲノムRNAとそれに結合したRdRp、そして
カプシドタンパク質からなるリボヌクレオタンパク質複合体を含んでいます。
カプシドタンパク質は、遺伝情報を保護する役割を果たします。アスピ
ウイルス科を除いて、ほとんどの(−)ssRNA
ウイルスは、この複合体が
脂質のエンベロープに包まれています。エンベロープ表面には
ウイルスのスパイクタンパク質などが存在し、宿主細胞への吸着や侵入に関わります。
ウイルス粒子(
ビリオン)の形は多様で、フィラメント状、球状、管状、あるいは不定形なものがあります。
疾患と歴史
(−)ssRNA
ウイルスは、ヒトや動物に多くの疾患を引き起こす病原体として知られています。歴史的に古くから認識されている疾患としては、
狂犬病や
麻疹、ハンタ
ウイルス感染症などがあります。近代においては、
エボラ出血熱や重症
インフルエンザなどの致死的な
アウトブレイクの原因となっています。
節足動物が媒介するものには、リフトバレー熱やトマト黄化えそ病を引き起こす
ウイルスがあります。脊椎動物の宿主としては、
コウモリや齧歯類が多くの
ウイルスの自然宿主となっています。
(−)ssRNA
ウイルスの研究は、20世紀初頭に始まりました。1925年に単離された水胞性口炎
ウイルスは、細胞培養での研究が可能だったため、初期の動物
ウイルス研究において重要な役割を果たしました。牛に壊滅的な被害をもたらした
牛疫は、(−)ssRNA
ウイルスの
牛疫ウイルスによって引き起こされていましたが、21世紀初頭に
天然痘に続いて根絶されました。近年の
ウイルスメタゲノミクス技術の進歩により、特に無脊椎動物から多数の(−)ssRNA
ウイルスが発見され、
ウイルスの進化史に関する理解が深まっています。RdRpの系統解析から、すべての(−)ssRNA
ウイルスが単一の祖先から派生したことが示され、現在のネガルナ
ウイルス門の分類体系へと繋がっています。