ポリン(Porin)
ポリンは、特異的な膜貫通型タンパク質であり、βバレル構造を持つことが特徴です。通常の膜輸送タンパク質とは異なり、ポリンは大きな孔を形成することで、分子が受動的に拡散することを許可します。この特性により、ポリンは
イオンチャネルとしての機能を果たし、様々な種類の分子の透過を促進します。主に、
グラム陰性菌、ミトコンドリア、
葉緑体の
外膜で見られます。
構造
ポリンの基本的な構造は、βシートが組み合わさって形成された円筒形のβバレルです。この構造は、コンパクトな形状が持つ利点を活かして、細胞膜を貫通します。ポリンは
細胞質側でβターンと呼ばれる部分と、長いアミノ酸ループによって結合されており、βシートは逆平行の配列になっています。このβシートには、
極性と無
極性のアミノ酸が交互に配置されており、それぞれが膜の外側や内部の環境と相互作用を持っています。
内部のポーターは「アイレット」と呼ばれる構造で部分的にブロックされており、これは主にバレルの5番目と6番目のストランドの間に位置しています。アイレットの存在により、ポリンを通過できる分子のサイズが制限されます。この構造には、主に荷電したアミノ酸が配置されており、孔内には横向きの電荷が作り出されています。特に、アイレットには4つの
グルタミン酸(Glu)と7つの
アスパラギン酸(Asp)が含まれており、余剰の負電荷を持っています。
この負電荷は、2つの
カルシウムイオンの影響を受けながら、1つの
ヒスチジン(His)、2つの
リシン(Lys)、3つの
アルギニン(Arg)の正電荷と相互作用します。このような不均一な電荷の配列が、ポリンを通過できる物質を校正する要因となっています。
細胞における役割
ポリンは、
糖やイオン、アミノ酸などの小さな物質の細胞内外への拡散に重要な役割を果たしています。特に、
グラム陰性菌においては内膜がほとんど透過性を持たないのに対し、
外膜に存在するポリンが1500ダルトン以下の物質の透過を可能にしています。これは、細胞が必要とする物質を効果的に取り込む上で重要な機能となります。
さらに、ヌクレオポリンと呼ばれるポリンは、
細胞核の
核膜孔を介した物質の輸送に寄与していますが、これは別のカテゴリとみなされることが多く、例えば、
MeSH(医学的主題見出し)の分類では異なる扱いを受けています。
関連項目
参考文献
外部リンク