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プトレシン

プトレシンは、腐肉の臭いの原因となるジアミンの一種です。生物体内のアミノ酸分解や細胞内で生成され、ポリアミンとして細胞機能に関与します。工業的にはナイロン原料、農業では植物の耐性向上や果物の鮮度維持に利用され、法医学では死亡時期推定の指標としても用いられます。


ヒドロキシメチルグルタリルCoA

ヒドロキシメチルグルタリルCoA(HMG-CoA)は、コレステロールなど生命維持に不可欠な分子の生合成経路であるメバロン酸経路の重要な中間体です。ケトン体生成や特定のアミノ酸代謝にも深く関わる、多機能な代謝物質と言えます。


チグリルCoA

チグリルCoAは、必須アミノ酸イソロイシンの生体内分解経路に現れる重要な中間代謝物です。この分子の代謝に関わる酵素の機能不全は、重篤な遺伝性代謝疾患であるチグリル-CoA脱水素酵素欠損症の原因となります。


タンパク質を構成しないアミノ酸

生物の遺伝情報に直接コードされず、タンパク質合成の主要な材料とはならないものの、多様な構造と機能を持つ数千種類のアミノ酸群。代謝、生理活性、毒性など、生命現象の多岐にわたる側面に関与します。


システインスルフィン酸

アミノ酸の一種であるシステインが体内で代謝される過程で一時的に現れる重要な中間生成物の一つ、それがシステインスルフィン酸です。システインジオキシゲナーゼの作用で生じ、アミノ酸ラセマーゼによりD-システインへと変換されるなど、生化学的な代謝経路において重要な役割を担います。


シスタチオニン

シスタチオニンは、硫黄を含むアミノ酸であるシステインの生合成経路における重要な中間体です。体内でホモシステインとセリンから合成され、システインとα-ケト酪酸に分解されます。その代謝異常はシスタチオニン尿症などの疾患と関連します。


サッカロピン

アミノ酸であるリシンの生合成や分解に関わる重要な代謝中間体。生物種によってその役割は異なり、リシンの前駆体または分解産物として生成する。特定の遺伝子異常はこの物質の蓄積を引き起こし、病気との関連も指摘されており、アミノ酸代謝経路を理解する上で欠かせない物質の一つ。


グルタリルCoA

グルタリルCoAは、必須アミノ酸であるリシンやトリプトファンが生体内で分解される代謝経路の重要な中間体として機能します。この物質の代謝経路が正常に機能することは生命活動に不可欠であり、その異常は特定の代謝性疾患の原因ともなり得ます。


グルタミン酸-1-セミアルデヒド

アミノ酸であるグルタミンに由来する重要な代謝中間体、グルタミン酸-1-セミアルデヒドに関する項目です。生体内では、オルニチンやプロリンといった他のアミノ酸を合成する上で不可欠な前駆体として機能するほか、ヒスチジン分解経路の一部にも関与しており、生物の恒常性維持に重要な役割を果たしています。


グルタコニルCoA

生体内における必須アミノ酸の一つであるリシンの分解代謝経路において、グルタコニルCoAは重要な中間体として位置づけられます。この化合物は、特定の酵素群の作用により後続の代謝産物へと変換され、リシン代謝の円滑な進行に欠かせない役割を果たしています。


クロトニルCoA

クロトニルCoAは、生化学的な経路において重要な役割を担う化合物です。特定の細菌による酪酸生成の過程や、アミノ酸であるリシンおよびトリプトファンの分解代謝経路において現れる中間体の一つとして知られています。これは、細胞内のエネルギー代謝や物質変換に関わる多様な酵素反応の基質や生成物となり得ます。生体内の物質代謝ネットワークにおけるその位置づけは、関連する酵素群と共に研究対象となっています。


キヌレニン

キヌレニンは、必須アミノ酸であるトリプトファンが体内で分解される過程(キヌレニン経路)において生成される重要な代謝中間体です。ナイアシンの生合成に関わるほか、生体内で多様な生理機能に関与し、特定の疾患との関連も指摘されています。


オルニチン

オルニチン(ornithine)はアミノ酸の一種であり、体内で発生する有害なアンモニアを無毒な尿素へと変換する、尿素回路において重要な役割を果たす物質です。アルギニンから生合成され、シジミをはじめとする様々な食品に含まれています。サプリメントとしても親しまれています。


イミダゾール-4-オン-5-プロピオン酸

イミダゾール-4-オン-5-プロピオン酸は、必須アミノ酸であるヒスチジンの生体内での分解過程で生成される重要な中間代謝物です。ウロカニン酸から特定の酵素の作用により作られ、さらに別の酵素によって別の化合物へと変換される役割を担います。


イソブチリルCoA

バリン代謝経路に現れる重要な中間体、イソブチリルCoA。特定の酵素反応を経てα-ケトイソ吉草酸から生成され、さらに別の酵素によりメタクリルCoAへと変換される。生命活動に不可欠なアミノ酸代謝の一端を担う物質。


イソバレリルCoA

イソバレリルCoAは、ヒトの体内における重要なアミノ酸の一つであるロイシンの分解過程で生成される中間代謝物です。この物質は、エネルギー産生経路の一部を担う代謝経路に位置し、特定の酵素によってさらに代謝されます。その代謝が滞ると、特定の疾患の原因となることもあり、生体内での正確な代謝経路における役割は重要です。


アリシン (アミノ酸)

アリシン(Allysine)、別名2-アミノアジピン酸-6-セミアルデヒドは、必須アミノ酸であるリシンから生合成されるアミノ酸の一つです。タンパク質の構成要素とは異なり、主に細胞外マトリックスの構造を安定化させる役割を担います。特にコラーゲンやエラスチンの繊維形成における架橋構造の生成に不可欠な物質です。


アグマチン

アグマチンは、アミノ酸の一種アルギニンから生合成される物質で、神経伝達物質としての機能を持つ可能性が示唆されています。生体内では多様な生理作用に関与し、特に神経保護作用が注目されています。その存在は古くから知られつつも、哺乳類での発見は比較的最近であり、現在も活発な研究が行われています。


Γ-グルタミルシステイン

γ-グルタミルシステイン(GGC)は、グルタミン酸とシステインが結合したジペプチドで、生体内で重要な抗酸化物質であるグルタチオンの合成に不可欠な中間体です。


Β-ヒドロキシブチリルCoA

β-ヒドロキシブチリルCoA(3-ヒドロキシブチリルCoA)は、特定の細菌による酪酸発酵や、リシン・トリプトファンといったアミノ酸の代謝経路で生成される重要な中間代謝産物です。エネルギー生成や物質変換において中心的な役割を果たします。


Α-ケト酪酸

α-ケト酪酸は、別名2-オキソ酪酸とも呼ばれる重要な代謝中間体です。アミノ酸代謝に関与し、特にシスタチオニンやトレオニンの分解経路で生成されます。その後、エネルギー代謝経路に組み込まれます。


Α-ケトイソ吉草酸

α-ケトイソ吉草酸(α-Ketoisovaleric acid)は、必須アミノ酸であるバリンが生体内で分解される過程で生成する重要な中間代謝産物です。化学構造的には3-メチル-2-オキソブタン酸として知られ、特定の酵素の働きによりバリンから生成し、さらに別の物質へと変換されていきます。生命活動におけるアミノ酸代謝経路の一部を担う化合物です。


Α-ケトイソカプロン酸

α-ケトイソカプロン酸は、必須アミノ酸であるロイシンの生体内代謝経路において生成される重要な中間体の一つです。この化合物は、ロイシンの分解や他の生体物質への変換過程で中心的な役割を果たしており、分岐鎖アミノ酸代謝の理解に不可欠な分子です。


Α-アミノアジピン酸

α-アミノアジピン酸は、生体内の代謝経路において特定の役割を担う有機化合物です。特に、必須アミノ酸であるリシン、およびリシン代謝の中間体であるサッカロピンの分解や変換の過程で一時的に生成される重要な中間体の一つとして位置づけられています。


S-アデノシル-L-ホモシステイン

S-アデノシル-L-ホモシステイン(SAH)は、広範な生物の代謝経路に不可欠なアミノ酸誘導体です。S-アデノシル-L-メチオニン(SAM)からの脱メチル化で生じ、システインやアデノシン合成における重要な中間体です。


N'-ホルミルキヌレニン

N′-ホルミルキヌレニンは、必須アミノ酸であるトリプトファンの主要な代謝経路であるキヌレニン経路における初期の重要な中間体です。トリプトファンにインドールアミン-2,3-ジオキシゲナーゼ(IDO)が作用することで生成され、さらにキヌレニンへと変換されます。生体の多様な生理機能に寄与するこの経路の出発点近くに位置する物質です。


4-マレイルアセト酢酸

4-マレイルアセト酢酸は、フェニルアラニンとチロシンという重要なアミノ酸の分解過程で生成される中間体です。この化合物は、ホモゲンチジン酸から特定の酵素によって作られ、さらに別の酵素により4-フマリルアセト酢酸に形を変えます。エネルギー代謝に繋がる物質へと変換される途上の重要な分子です。


4-フマリルアセト酢酸

アミノ酸であるフェニルアラニンおよびチロシンの生体内代謝経路で生成される重要な中間体。その分解はフマリルアセトアセターゼにより行われ、この酵素の異常は遺伝性疾患であるチロシン血症I型の原因となる。


4-ヒドロキシフェニルピルビン酸

4-ヒドロキシフェニルピルビン酸は、生体内でフェニルアラニンやチロシンなどの芳香族アミノ酸が分解される過程で生成される重要な中間代謝産物です。チロシンがエネルギーや他の物質に変換される際の主要な経路に位置しています。


3-メチルグルタコニルCoA

3-メチルグルタコニルCoAは、必須アミノ酸であるロイシンの生体内での分解過程に現れる重要な中間代謝産物です。この分子は、特定の酵素反応によって合成され、さらに別の代謝経路を経て、エネルギー産生や脂質合成に関わる物質へと変換されます。その役割と代謝経路における位置づけは、ロイシンの適切な代謝機能にとって不可欠であり、関連酵素の異常は代謝疾患の原因となり得ます。


3-メチルクロトニルCoA

3-メチルクロトニルCoA(β-Methylcrotonyl-CoA)は、必須アミノ酸であるロイシンの分解過程で生じる重要な代謝中間体の一つです。イソバレリルCoAから酵素反応によって生成し、さらに次の代謝段階へと進みます。この物質はロイシン代謝経路における鍵となる化合物であり、エネルギー産生などに関わる最終産物への変換に不可欠な役割を果たします。


3-ヒドロキシキヌレニン

3-ヒドロキシキヌレニンは、必須アミノ酸であるトリプトファンが体内で代謝される過程で生成される物質の一つです。この化合物は、特に人間の目の重要な器官である水晶体において、太陽光に含まれる有害な紫外線を効果的に吸収し、目の健康を維持するための天然のフィルターとしての重要な役割を担っています。


3-ヒドロキシイソ酪酸

3-ヒドロキシイソ酪酸は、必須アミノ酸の一つであるバリンの生体内代謝経路において重要な中間体として生成される有機酸です。バリンの分解過程に不可欠な役割を担っており、その後の代謝産物への変換を可能にする橋渡し役を務めます。ヒトを含む多くの生物の体内で見出される物質です。


3-ヒドロキシイソブチリルCoA

バリンとして知られる分岐鎖アミノ酸の生体内における分解過程で生成される重要な代謝中間体の一つ。 この化合物は、正式名称を3-ヒドロキシイソブチリルCoAまたは3-ヒドロキシ-2-メチルプロパノイルCoAと呼ばれ、CoA(コエンザイムA)と結合した高エネルギーエステルとして存在します。


3-ヒドロキシアントラニル酸

トリプトファンという必須アミノ酸の代謝過程で重要な役割を果たすキヌレニン経路。その複雑な一連の化学反応の途中で生成される物質が、3-ヒドロキシアントラニル酸です。代謝の中間段階に現れる化合物の一つとして位置づけられます。


2-メチルブチリルCoA

イソロイシンという必須アミノ酸が体内で分解される過程で生じる中間体のひとつ、それが2-メチルブチリルCoAです。この分子は、イソロイシンのエネルギー変換や他の生体物質への再利用に関わる重要なステップを担っており、その代謝経路が正常に機能することは健康維持に不可欠です。関連する酵素の働きが損なわれると、体内に異常な蓄積が生じ、特定の代謝疾患を引き起こす可能性が知られています。イソロイシン代謝におけるその位置づけと重要性について解説します。


2-メチルアセトアセチルCoA

2-メチルアセトアセチルCoA(2-Methylacetoacetyl-CoA)は、必須アミノ酸であるイソロイシンが生体内でエネルギーとして利用される際に経由する、その分解経路における重要な中間体の一つです。


2-メチル-3-オキソプロパン酸

2-メチル-3-オキソプロパン酸は、別名メチルマロン酸セミアルデヒドとも呼ばれ、分岐鎖アミノ酸の一つであるバリンの生体内代謝経路において重要な中間体となる有機酸です。


2-アミノムコン酸セミアルデヒド

必須アミノ酸であるトリプトファンが体内で分解される過程で生成される、重要な代謝中間体の一つです。特にキヌレニン経路において生じ、様々な生理活性物質へと変換される化合物。


2-アミノムコン酸

2-アミノムコン酸は、人体にとって必須アミノ酸であるトリプトファンが代謝される主要な経路(キヌレニン経路)において生じる、重要な化学中間体の一つです。この物質は、その後の代謝反応を経て様々な生理活性物質やエネルギー産生に寄与する化合物へと変換されます。


2-アミノ-3-カルボキシムコン酸セミアルデヒド

2-アミノ-3-カルボキシムコン酸セミアルデヒドは、必須アミノ酸であるトリプトファンの分解過程で生成する中間体の一つです。この物質からは、哺乳類体内で神経毒として知られるキノリン酸が非酵素的に生じることが知られています。


2,3-ジヒドロキシ-3-メチルペンタン酸

2,3-ジヒドロキシ-3-メチルペンタン酸は、必須アミノ酸であるイソロイシンの生体内での分解代謝経路に現れる重要な中間体の一つです。この物質は、イソロイシンの最終的なエネルギー変換に至る過程で生成され、その後の代謝ステップを経て分解されます。イソロイシン代謝の研究において注目される化合物です。


1-ピロリン-5-カルボン酸

1-ピロリン-5-カルボン酸(P5C)は、環状構造を持つイミノ酸の一つです。生体内では特に(S)体が重要であり、プロリンというアミノ酸の代謝経路における中心的な中間体として機能します。プロリンから合成されると同時に、グルタミン酸への変換に関与し、アミノ酸代謝ネットワーク内で重要な役割を担っています。


ウリジン二リン酸グルクロン酸

ウリジン二リン酸グルクロン酸(UDP-グルクロン酸)は、UDPにグルクロン酸が結合した糖ヌクレオチド。多糖合成やグルクロン酸抱合反応における重要な糖供与体であり、アスコルビン酸生合成の中間体としても機能する。


ウリジン二リン酸ガラクトース

ウリジン二リン酸ガラクトース(UDP-ガラクトース)は、生体内で見られるヌクレオチド糖の一種です。多糖の生合成過程や、ヌクレオチド糖の代謝において、活性型の中間体として不可欠な役割を果たしています。いくつかの重要な酵素反応に関与し、特にルロワール経路の一部として機能します。


ウリジン二リン酸-N-アセチルグルコサミン

ウリジン二リン酸N-アセチルグルコサミン(UDP-GlcNAc)は、糖ヌクレオチド補酵素として、糖鎖合成や細胞内シグナル伝達に不可欠です。生合成経路を経て体内で産生され、グリコサミノグリカンや糖脂質などの重要な生体分子構築に関与します。グルコース感知や疾患、植物の生理機能制御にも関わることが知られています。


高度好塩菌

高度好塩菌は、高い塩分濃度を必要とする古細菌(アーキア)の主要な一群です。塩湖や塩田などに広く分布し、独特の生理機能や光エネルギー利用能力(バクテリオロドプシン)を持ちます。その生態や進化は、極限環境生物研究において重要な位置を占めています。


遠洋性堆積物

遠洋性堆積物は、陸から遠く離れた外洋の海底に沈む微細な粒子が集まってできた堆積物です。主にプランクトンの殻や粘土から成り、地球の海底の大部分を覆っています。過去の地球環境変動を知る上で重要な記録となります。


逆クエン酸回路

逆クエン酸回路は、一部の細菌が二酸化炭素と水から有機化合物を合成する化学反応経路です。生命の起源にも関連する炭素固定の仕組みとして注目されています。


緑色非硫黄細菌

緑色非硫黄細菌は、糸状の群体を形成し滑走運動を行う光合成細菌の一群。酸素を発生しない独特な光合成を行い、温泉などに生息する好熱性の種が多い。分類上の混乱もあり、専門家からは糸状光栄養細菌(FAP)とも呼ばれる。広義にはクロロフレクサス門全体を指す場合もある。


緑色硫黄細菌

緑色硫黄細菌は、光エネルギーを利用し硫化水素などで光合成を行う絶対嫌気性の細菌群です。特徴的な色素体クロロソームを持ち、深海などの特殊環境にも生息。光合成研究のモデルとしても利用される興味深い微生物です。


紅色細菌

紅色細菌は、酸素を発生しない光合成細菌の総称で、カロテノイドにより赤や褐色に見えます。狭義には光合成能を持つ種を指し、多系統群としてプロテオバクテリア門に広く分布。その特徴、分類、光化学系を解説します。


紅色硫黄細菌

紅色硫黄細菌は、水ではなく硫化水素を電子供与体として光合成を行う細菌の一群です。赤色や褐色を呈し、硫黄泉や湖などの光が当たる無酸素水域に生息します。酸素を発生させずに単体硫黄を生み出す特異な代謝が特徴です。


硫酸還元菌

硫酸を電子の最終受容体として利用し、硫化水素を生成する微生物群。地球最古の生命の一つで、硫黄循環や有機物分解に重要。環境問題の原因や浄化への応用もある多様な存在です。


生物地球化学的循環

地球上の物質が生物圏や水圏、大気圏、岩石圏など、生物・無生物の間を多様な経路を経て移動・循環し、再利用される現象を指す。長い時間スケールで見た地球の物質リサイクルシステム。


生物ポンプ

海洋表層で生物が利用した炭素を深部へ輸送する経路。光合成で固定された大気中の二酸化炭素を深海へ運び、地球の炭素循環や気候変動、特に温暖化対策において重要な役割を担う。粒子や溶解物、有機・無機など多様な形態で運ばれる。


炭酸塩補償深度

炭酸塩補償深度(CCD)は、海水中の炭酸塩(主に炭酸カルシウム)が溶解せずに海底に堆積できる限界の深さです。これより深い場所では、炭酸塩は溶解し海底堆積物を形成しません。その深さは海域や水温、圧力などによって変動します。


微生物環

海洋生態系における栄養経路の一つ、微生物環(マイクロビアルループ)について解説します。溶存有機物、従属栄養性細菌、微小動物プランクトンを介した物質循環であり、従来の食物連鎖だけでは捉えきれなかった海洋でのエネルギー・物質フローの解明に不可欠な概念です。1980年代に提唱され、その重要性が広く認識されています。


地球大気中の二酸化炭素

地球大気における二酸化炭素(CO2)は、地球の長い歴史の中でその濃度を変動させてきました。本記事では、地球史スケールでのCO2濃度変化の背景、現代の状況と将来の見通し、そして関連する炭素循環や地球内部の炭素に関する最新の研究について解説します。


土壌呼吸

土壌呼吸とは、土壌中の微生物や植物の根がCO2を放出する現象。地球の炭素循環の要であり、気候変動や人間活動に影響される重要な生態系プロセス。


北極圏メタンガス放散

北極圏の永久凍土や海底からメタンガスが放出される現象。温暖化による永久凍土融解が放出を加速させ、強力な温室効果ガスであるメタンがさらなる温暖化を招く正のフィードバック機構として注目される。


全量炭素カラム観測ネットワーク

地球大気中の二酸化炭素やメタンなど温室効果ガス、その他微量成分の量を高精度に測定する世界規模の観測ネットワーク。衛星観測の検証や炭素循環研究に貢献。


二酸化炭素吸収源

大気中の二酸化炭素などの温室効果ガスを自然または人工的なプロセスで取り除く仕組みや場所を指します。森林、海洋、土壌などがこれにあたり、地球温暖化の緩和策として重要な役割を担っています。


レッドフィールド比

レッドフィールド比とは、海洋の植物プランクトンや深層海水に見られる炭素、窒素、リンの原子比です。海洋学者A.レッドフィールドが発見し、C:N:P = 106:16:1が標準とされます。海洋の生物地球化学循環や生産性を理解する上で不可欠な概念です。


リブロース1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼ

光合成の主要な炭酸固定酵素であり、地球上で最も豊富なタンパク質。CO2固定(カルボキシラーゼ)とO2付加(オキシゲナーゼ)の競合反応を持ち、植物の生産性を左右するため研究が進められています。


リブロース-1,5-ビスリン酸

リブロース-1,5-ビスリン酸(RuBP)は、植物の光合成におけるカルビン回路の中心的な5炭素糖リン酸です。二酸化炭素を取り込み、様々な有機物の合成に繋がる重要な分子です。RuBisCO酵素が触媒しますが、酸素を取り込み光呼吸を引き起こす可能性もあります。


メタン生成経路

メタン生成経路は、メタン菌が有する特異な代謝系で、水素や二酸化炭素などを利用してメタンを生成します。嫌気環境下で有機物分解の最終段階を担い、独自の補酵素や酵素群を必要とします。エネルギー問題や地球温暖化とも関連する重要なプロセスです。


マリンスノー

深海に降り注ぐ、有機物や無機物からなる白い粒子状の懸濁物。深海生物の食料源となり、炭素を深海へ運ぶ生物ポンプとして地球の炭素循環に重要な役割を果たします。


ホルミルメタノフランデヒドロゲナーゼ

ホルミルメタノフランデヒドロゲナーゼは、ホルミルメタノフラン、水、受容体を基質とし、二酸化炭素、メタノフラン、還元型受容体を生成物とする酸化還元反応を触媒する酵素。モリブデンとプテリンを補因子として必要とする。組織名はformylmethanofuran:acceptor oxidoreductase。


ヘリオバクテリウム科

ヘリオバクテリウム科は、絶対嫌気条件下で光エネルギーを利用する特異な細菌群。グラム陽性菌門に属しながら、光化学系Iに似た反応中心を持ち、バクテリオクロロフィルgで光を捉える。耐性胞子で酸素環境にも耐える。


バクテリオクロロフィル

バクテリオクロロフィルは、紅色細菌や紅色硫黄細菌に見られる青緑色の光合成色素。化学的にクロロフィルに酷似しており、光エネルギーを吸収して細菌の光合成を支える役割を担う。細菌葉緑素とも呼ばれる。


クロロフレクサス門

クロロフレクサス門は、細菌の大きな系統群の一つ。かつて緑色非硫黄細菌を中心に定義されたが、現在は16S rRNA遺伝子解析に基づき、光合成性から多様な非光合成性の種までを含む。グラム陰性、陽性、糸状、桿菌など形態も多様。外膜を持たないユニークな特徴を持つ。


クロロビウム門

クロロビウム門は、緑色硫黄細菌を中核とするグラム陰性細菌の門です。かつては光合成を行う緑色硫黄細菌のみと考えられていましたが、新たな細菌の発見によりその分類は拡大し、多様な性状を持つ細菌が含まれることが明らかになっています。本項ではクロロビウム門の概要を解説します。


ギ酸デヒドロゲナーゼ (NADP+)

ギ酸デヒドロゲナーゼ (NADP+) は、ギ酸とNADP+を基質とし、CO2とNADPHを生成する酸化還元酵素です。メタン代謝に関与し、鉄、タングステン、セレンを補因子として用いる微生物酵素です。


ガンマプロテオバクテリア綱

真正細菌プロテオバクテリア門に属するグラム陰性の綱です。医学的に重要な病原菌や、多様な代謝能力を持つ細菌を多く含んでいます。


カルビン回路

光合成の代表的な炭酸固定経路であるカルビン回路は、ATPとNADPHを駆動力に二酸化炭素から糖を合成します。多くの植物や細菌に存在し、RubisCOなど光に活性化される酵素が関わる重要な代謝経路です。


アルファプロテオバクテリア綱

アルファプロテオバクテリア綱は、細菌ドメインのプロテオバクテリア門に属する多様な細菌群です。光合成から寄生まで幅広い生態を持ち、真核生物のミトコンドリアの祖先と考えられています。その進化は生命の起源を探る上で重要です。


アクウィフェクス門

アクウィフェクス門は、温泉や海底火山付近の熱水域に生息するグラム陰性の好熱性細菌のグループです。主に水素を酸化してエネルギーを得る独立栄養生物で、古細菌を除けば最も高い温度で生育可能な生物群の一つです。


アキドバクテリウム門

アキドバクテリウム門は、地球上の多様な環境に広く分布するグラム陰性細菌の大型グループです。実験室での培養が難しいため未知の部分が多いですが、DNA解析からその高い多様性が示唆されています。特に土壌環境で普遍的に見出されます。


C3型光合成

C3型光合成は、植物が二酸化炭素を固定する基本的な方法の一つで、カルビン・ベンソン回路のみで行われます。多くの植物に見られますが、特定の環境下ではC4型光合成を行う植物に比べて不利になることがあります。


C/N比

有機物に含まれる炭素と窒素の質量比を指すC/N比は、土壌中の微生物活動と窒素循環に深く関わり、作物の生育に必要な窒素の利用可能性に影響を与える重要な指標です。


3-ホスホグリセリン酸

3-ホスホグリセリン酸(3PG)は、生命活動の根幹を支える生化学的に重要な化合物です。解糖系やカルビン回路といった主要なエネルギー代謝経路の中間体として登場し、さらに特定のアミノ酸を作り出す際の出発物質ともなります。


食細胞

動物体内で異物を認識し、これを呑み込んで消化・破壊する細胞の総称。細胞性免疫の初期応答を担い、病原体や死細胞の除去に不可欠な働きをする。マクロファージや好中球、樹状細胞などが含まれる主要な免疫担当細胞である。


松本亮 (薬学者)

日本の薬学者(生化学)。複合脂質、特にリン脂質や糖代謝の研究で知られ、多数の賞を受賞。東京大学、静岡薬科大学、静岡県立大学で教育・研究に貢献し、日本の脂質生化学の発展に寄与しました。


リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ

リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ(EC 5.1.3.1、PPE)は、ペントースリン酸回路などで重要な働きをする酵素。D-リブロース-5-リン酸をD-キシルロース-5-リン酸へ変換し、炭素固定や糖代謝に関与。細菌から植物まで広く存在し、TIMバレル構造を持つ異性化酵素。


リブロース-5-リン酸

リブロース-5-リン酸は、細胞のエネルギー産生や物質合成を支えるペントースリン酸経路の主要な生成物の一つであり、植物などが光合成で行うカルビン回路における重要な中間体です。生体内で様々な糖代謝に関わる中心的な役割を担っています。


ラクトースシンターゼ

ラクトースシンターゼは、哺乳類の乳腺で乳糖の生合成を担う重要な酵素複合体です。この酵素は、N-アセチルラクトサミンシンターゼと、その活性を制御するα-ラクトアルブミンの二つの異なるタンパク質サブユニットから構成され、UDP-ガラクトースとグルコースを基質としてラクトースとUDPを生成する反応を触媒します。


ラクターゼ

ラクターゼは、乳製品に含まれる乳糖(ラクトース)を分解する消化酵素です。ヒトの小腸で生成され、乳糖の消化吸収に重要な役割を果たします。不足すると乳糖不耐症を引き起こすため、製剤も存在します。食品工業においても幅広く活用されています。


ホスホピルビン酸ヒドラターゼ

ホスホピルビン酸ヒドラターゼ、別名エノラーゼは、解糖系に必須の酵素です。2-ホスホグリセリン酸からホスホエノールピルビン酸への変換を触媒し、ヒトには複数のアイソザイムが存在します。エノラーゼスーパーファミリーに属し、フッ素によって阻害されます。


ホスホグルコン酸デヒドロゲナーゼ (脱炭酸)

ホスホグルコン酸デヒドロゲナーゼ (脱炭酸) は、6-ホスホグルコン酸をNADP+と共に酸化・脱炭酸し、D-リブロース-5-リン酸とCO2、NADPHを生成する酵素です。ペントースリン酸経路の一員として、細胞に必要なNADPH供給に貢献します。


ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ

ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ(PEPCK)は、糖新生の重要な酵素。オキサロ酢酸をホスホエノールピルビン酸に変換する。ヒトには細胞質型とミトコンドリア型があり、血糖恒常性やがんなど多様な生理機能に関わる。


フルクトース-1-リン酸

フルクトースの代謝過程で生じる重要な中間体であるフルクトース-1-リン酸について解説します。主に肝臓でフルクトキナーゼによって生成され、エネルギー産生や脂質合成など多様な生化学的経路に関与する、フルクトース代謝の鍵となる物質です。


ピルビン酸カルボキシラーゼ

ピルビン酸カルボキシラーゼは、ピルビン酸からオキサロ酢酸を合成する重要なリガーゼ酵素。ミトコンドリア内に存在し、クエン酸回路の補充や糖新生の初段階を担う。ビオチンを補因子とし、肝臓で中心的に機能する。


トランスケトラーゼ

トランスケトラーゼは、生物界に広く存在する酵素で、ペントースリン酸経路や光合成のカルビン回路における重要な炭素骨格転移反応を触媒します。特に哺乳類では、NADPHの供給源として生合成に不可欠な役割を担っています。


セドヘプツロース-7-リン酸

セドヘプツロース-7-リン酸(S7P)は、ペントースリン酸経路や光合成を行う生物におけるカルビン回路で重要な役割を果たす代謝中間体です。これは、これらの生化学的経路内で特定の酵素反応によって合成される化合物です。


コリ回路

コリ回路は、激しい運動などで筋肉に酸素が不足した際に発生する乳酸を、肝臓で糖(グルコース)に再変換し、これを全身へ供給する代謝経路です。筋疲労の原因となる乳酸を処理し、エネルギー供給を循環させる重要な働きを持ちます。


グルコース-アラニン回路

肝臓と筋肉を結ぶ代謝経路。筋肉で消費されたグルコースがアラニンに変換され肝臓へ。肝臓ではアラニンから再びグルコースが作られ筋肉へ送られる。運動時のエネルギー供給やアミノ酸代謝における窒素処理に関わる重要な循環経路。


グルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ

グルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ(G6PD)は、細胞内で重要な還元分子NADPHを生成する酵素。ペントースリン酸経路に関わり、細胞の酸化ストレス防御や生合成を支える。遺伝的欠損は溶血性貧血(G6PD欠損症)の原因となる。


グルコース-6-ホスファターゼ

グルコース-6-ホスファターゼは、細胞内のグルコース-6-リン酸からリン酸を取り除き、グルコースとして細胞外へ放出可能にする重要な酵素です。主に肝臓と腎臓に存在し、血糖値の維持に不可欠な役割を果たしています。この酵素の欠乏は遺伝性の代謝疾患であるフォン・ギールケ病を引き起こします。


グルコース-1-リン酸

グルコース-1-リン酸(G1P)は、グルコースの1位がリン酸化された誘導体です。生体内では、グリコーゲン代謝経路における分解と合成の両方で中心的な役割を担う重要な中間体として機能します。


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